Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DDX58O95786 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DDX58O95786 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DDX58O95786 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DDX58O95786 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX58O95786 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX58O95786 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX58O95786 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DDX58O95786 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DDX58O95786 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DDX58O95786 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DDX58O95786 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms