Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SEC24BO95487 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SEC24BO95487 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEC24BO95487 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms