Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SRP72O76094 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SRP72O76094 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SRP72O76094 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SRP72O76094 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP72O76094 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP72O76094 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP72O76094 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP72O76094 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP72O76094 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP72O76094 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP72O76094 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP72O76094 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP72O76094 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP72O76094 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms