Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SRGAP2O75044 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SRGAP2O75044 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms