Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN2BO60939 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCN2BO60939 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms