Protein–RNA interactions for Protein: O60565

GREM1, Gremlin-1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM1O60565 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GREM1O60565 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GREM1O60565 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GREM1O60565 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GREM1O60565 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREM1O60565 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREM1O60565 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GREM1O60565 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms