Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUBNO60494 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CUBNO60494 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CUBNO60494 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CUBNO60494 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CUBNO60494 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CUBNO60494 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CUBNO60494 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CUBNO60494 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUBNO60494 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CUBNO60494 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms