Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSL4O60488 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACSL4O60488 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL4O60488 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms