Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP104O60308 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CEP104O60308 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CEP104O60308 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CEP104O60308 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CEP104O60308 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CEP104O60308 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CEP104O60308 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CEP104O60308 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CEP104O60308 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CEP104O60308 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms