Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SYNGR2O43760 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SYNGR2O43760 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms