Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFA2T2O43439 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFA2T2O43439 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CBFA2T2O43439 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms