Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RASA4O43374 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RASA4O43374 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RASA4O43374 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RASA4O43374 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RASA4O43374 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RASA4O43374 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RASA4O43374 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RASA4O43374 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RASA4O43374 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASA4O43374 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASA4O43374 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RASA4O43374 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASA4O43374 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASA4O43374 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASA4O43374 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RASA4O43374 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RASA4O43374 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RASA4O43374 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms