Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRGAP3O43295 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SRGAP3O43295 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRGAP3O43295 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms