Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CEP290O15078 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CEP290O15078 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CEP290O15078 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP290O15078 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CEP290O15078 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CEP290O15078 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CEP290O15078 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CEP290O15078 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CEP290O15078 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
CEP290O15078 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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