Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCF2LO15068 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCF2LO15068 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms