Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SYNMO15061 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SYNMO15061 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SYNMO15061 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SYNMO15061 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SYNMO15061 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYNMO15061 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYNMO15061 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SYNMO15061 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNMO15061 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNMO15061 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNMO15061 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SYNMO15061 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYNMO15061 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SYNMO15061 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SYNMO15061 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SYNMO15061 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNMO15061 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNMO15061 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNMO15061 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SYNMO15061 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SYNMO15061 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms