Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOCS3O14543 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOCS3O14543 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms