Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KPNA3O00505 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KPNA3O00505 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms