Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOC4-APOC2K7ER74 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms