Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG3

SMKR1, Small lysine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1H3BMG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMKR1H3BMG3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMKR1H3BMG3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms