Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms