Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LRRN3E7EW58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LRRN3E7EW58 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.6 ms