Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L11C9JVI0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L11C9JVI0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms