Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRDCB7Z8K6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRDCB7Z8K6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms