Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DGG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DGG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DGG1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DGG1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DGG1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DGG1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
B4DGG1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DGG1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms