Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM114B3SHH9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM114B3SHH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM114B3SHH9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms