Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD1B0YJ81 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HACD1B0YJ81 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms