Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VGLL3A8MV65 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VGLL3A8MV65 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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