Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMIM23A6NLE4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMIM23A6NLE4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms