Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf118A6NHY6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf118A6NHY6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms