Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HELTA6NFD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HELTA6NFD8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms