Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTAGE9A4FU28 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CTAGE9A4FU28 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTAGE9A4FU28 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms