Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRAMEF22A3QJZ6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms