Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRBV4-1A0A0J9YWV2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms