Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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SCG3Q8WXD2 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SCG3Q8WXD2 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SCG3Q8WXD2 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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SCG3Q8WXD2 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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SCG3Q8WXD2 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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SCG3Q8WXD2 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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SCG3Q8WXD2 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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SCG3Q8WXD2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SCG3Q8WXD2 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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