Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RPS6KA1-220ENST00000531382 2359 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ALDH3A2-219ENST00000579855 3583 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CACNA1G-204ENST00000359106 7648 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 PCSK9-201ENST00000302118 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 SUN2-202ENST00000405510 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 LINC02080-201ENST00000585863 3085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ZNF300-203ENST00000418587 3226 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 ACOXL-202ENST00000389811 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NBR1Q14596 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NBR1Q14596 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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