Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MYOZ3-205ENST00000520112 605 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NLRP1-202ENST00000269280 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZMPSTE24-201ENST00000372759 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TMEM225BP0DP42 TBC1D3F-201ENST00000620210 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms