Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SCG3Q8WXD2 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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