Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ARHGEF9-220ENST00000635729 1761 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GSDMB-201ENST00000309481 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 HYLS1-201ENST00000356438 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PTPRJQ12913 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.6 ms