Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MKL1-213ENST00000620651 3757 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PAX3-205ENST00000392069 3170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRIP12-205ENST00000409677 1507 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PPP1R32-203ENST00000432063 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 ZNF215-207ENST00000610573 1503 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 UGT1A1-201ENST00000305208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPOP42166 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms