Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAPN2P17655 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms