Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ZNF135-201ENST00000313434 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 CDKL2-201ENST00000307465 2565 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PMEL-204ENST00000548493 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ATP4A-201ENST00000262623 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LDB3-203ENST00000372056 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 SLC18A1-201ENST00000265808 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RGS3-204ENST00000350696 4387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKOR2Q2VWA4 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms