Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 POLR2F-213ENST00000606538 760 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PLEKHG3-203ENST00000471182 3106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MME-204ENST00000462745 3590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AACS-201ENST00000316519 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDC27P30260 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms