Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE8P-201ENST00000333385 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE11-201ENST00000340073 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE9P-203ENST00000575125 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KLF8-202ENST00000374928 4821 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LRSAM1-202ENST00000323301 3376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 BEST3-201ENST00000266661 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC131888.1-201ENST00000625028 2168 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PCGF2-204ENST00000616199 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 STXBP1-221ENST00000637953 3925 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AMPD2-203ENST00000358729 2838 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CHMP3-201ENST00000263856 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC122688.3-201ENST00000623804 3467 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 AIF1L-206ENST00000372302 3340 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 FER1L5-207ENST00000641731 6294 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HMGB1P1B2RPK0 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms