Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KRT42P-201ENST00000398469 2864 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PLA2G4E-AS1-201ENST00000499478 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 GOLGA6L7P-201ENST00000567390 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 TPO-204ENST00000382198 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HERC3Q15034 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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