Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TROAP-201ENST00000257909 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 KLC4-215ENST00000479388 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF839-206ENST00000558850 2971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HTR5A-AS1-201ENST00000395731 2703 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LRRC8B-202ENST00000358200 1957 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CTBP2-201ENST00000309035 3669 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 EMB-201ENST00000303221 4281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IL36RN-201ENST00000346807 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 POTEH-201ENST00000343518 1928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RUNX1T1-202ENST00000360348 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PYGL-205ENST00000532462 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 WARS-202ENST00000355338 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC138749.1-201ENST00000567652 2472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NF2-207ENST00000397789 1857 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AP3B2-202ENST00000535348 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL121772.1-201ENST00000618303 2335 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 C1orf127-201ENST00000377004 2761 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 IKZF1-210ENST00000439701 3572 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 SLC25A36-208ENST00000507429 3537 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 CDK20-203ENST00000375871 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 RGS8-201ENST00000258302 5606 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC080112.4-201ENST00000623156 2491 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 NPY1R-201ENST00000296533 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LSAMPQ13449 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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