Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLURP1-201ENST00000246515 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GYG2P1-203ENST00000382965 149 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC004231.1-201ENST00000418393 815 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RPL7AP4-201ENST00000483820 769 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL589743.2-201ENST00000547821 602 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SMIM22-204ENST00000588606 394 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MIR1914-201ENST00000607800 80 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADGRG5-207ENST00000615867 762 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CDK7-202ENST00000502604 1455 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NME1-201ENST00000013034 796 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AP001630.1-201ENST00000428410 437 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC079988.1-201ENST00000432984 544 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 C12orf73-205ENST00000547945 463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DDTP1-201ENST00000443589 383 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC104758.4-201ENST00000565869 353 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PCDHGB2-201ENST00000522605 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TBP-201ENST00000230354 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATRXP46100 PPP1R2P9-201ENST00000378131 880 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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