Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SLC22A18AS-202ENST00000526203 664 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL391832.3-201ENST00000549744 846 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 MRPL55-210ENST00000366736 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC012066.1-201ENST00000439252 694 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EPCAMP16422 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms