Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GSN-205ENST00000373823 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PLK4-203ENST00000507249 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 DPP3-215ENST00000541961 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 C1QTNF3-201ENST00000231338 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 UGGT2-203ENST00000376747 4832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GAL3ST4-203ENST00000413800 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 RP2-201ENST00000218340 3803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 HEXIM1-201ENST00000332499 3600 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SNAP91-212ENST00000520302 4136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SKOR2Q2VWA4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms