Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL590705.1-202ENST00000366109 578 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC087222.1-201ENST00000571113 504 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC020663.1-201ENST00000588099 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC011471.2-201ENST00000588192 523 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PASK-216ENST00000629419 216 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL589826.2-201ENST00000635423 993 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RAD9B-202ENST00000392672 1846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MLN-201ENST00000266003 527 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SGK494-201ENST00000301037 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TSPAN16-201ENST00000316737 1040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL451165.1-201ENST00000334441 328 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ATP6V1G2-206ENST00000376151 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC004000.1-201ENST00000414435 433 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL772155.2-201ENST00000443910 472 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC072022.2-201ENST00000449623 672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RN7SL186P-201ENST00000466485 297 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PIEZO1P1-201ENST00000485427 219 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RN7SL386P-201ENST00000485776 297 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC091849.2-201ENST00000503113 692 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC091114.1-201ENST00000522815 630 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL132709.1-205ENST00000556136 551 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC126773.3-201ENST00000562089 893 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 BPIFA1-204ENST00000618484 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC004951.1-201ENST00000447643 1866 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC16A7-216ENST00000552432 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC078850.1-201ENST00000514265 1623 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HLA-DQA2-210ENST00000374940 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SPATA32-201ENST00000331780 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL021068.1-201ENST00000392097 911 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC005587.1-201ENST00000401879 592 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SNHG15-201ENST00000438705 509 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ITIH4-AS1-201ENST00000478366 395 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC079360.1-201ENST00000543848 434 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC023983.1-201ENST00000579347 567 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MIR4418-201ENST00000581169 62 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RN7SL491P-201ENST00000584748 269 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AFMID-208ENST00000588800 647 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DDX41-218ENST00000625286 150 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TIRAP-202ENST00000392679 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TMEM253-201ENST00000418511 1526 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 NDRG4-254ENST00000569923 1312 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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